Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hcn4O70507 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn4O70507 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hcn4O70507 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hcn4O70507 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms