Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb5O70309 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb5O70309 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb5O70309 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb5O70309 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb5O70309 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb5O70309 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb5O70309 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Itgb5O70309 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms