Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChadO55226 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChadO55226 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChadO55226 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChadO55226 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChadO55226 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChadO55226 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChadO55226 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChadO55226 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ChadO55226 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChadO55226 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChadO55226 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChadO55226 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChadO55226 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChadO55226 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChadO55226 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChadO55226 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChadO55226 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChadO55226 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChadO55226 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChadO55226 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChadO55226 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChadO55226 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChadO55226 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ChadO55226 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChadO55226 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChadO55226 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChadO55226 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChadO55226 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChadO55226 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChadO55226 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChadO55226 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChadO55226 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChadO55226 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ChadO55226 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChadO55226 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChadO55226 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChadO55226 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChadO55226 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChadO55226 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChadO55226 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChadO55226 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChadO55226 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChadO55226 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChadO55226 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChadO55226 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChadO55226 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ChadO55226 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChadO55226 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ChadO55226 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ChadO55226 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChadO55226 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChadO55226 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChadO55226 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ChadO55226 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChadO55226 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChadO55226 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChadO55226 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChadO55226 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ChadO55226 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChadO55226 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChadO55226 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChadO55226 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChadO55226 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChadO55226 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChadO55226 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChadO55226 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChadO55226 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChadO55226 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChadO55226 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChadO55226 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChadO55226 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChadO55226 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChadO55226 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChadO55226 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChadO55226 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChadO55226 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChadO55226 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChadO55226 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChadO55226 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChadO55226 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ChadO55226 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChadO55226 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChadO55226 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChadO55226 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChadO55226 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChadO55226 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChadO55226 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChadO55226 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChadO55226 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChadO55226 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChadO55226 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChadO55226 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChadO55226 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChadO55226 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChadO55226 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChadO55226 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ChadO55226 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChadO55226 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChadO55226 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms