Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PnnO35691 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PnnO35691 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PnnO35691 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PnnO35691 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
PnnO35691 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PnnO35691 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PnnO35691 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PnnO35691 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PnnO35691 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PnnO35691 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PnnO35691 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PnnO35691 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PnnO35691 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PnnO35691 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PnnO35691 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PnnO35691 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PnnO35691 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PnnO35691 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PnnO35691 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PnnO35691 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PnnO35691 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PnnO35691 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PnnO35691 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PnnO35691 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PnnO35691 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PnnO35691 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PnnO35691 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PnnO35691 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PnnO35691 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PnnO35691 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PnnO35691 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PnnO35691 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PnnO35691 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PnnO35691 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnnO35691 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnnO35691 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnnO35691 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnnO35691 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnnO35691 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnnO35691 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnnO35691 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnnO35691 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnnO35691 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PnnO35691 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnnO35691 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PnnO35691 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PnnO35691 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PnnO35691 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnnO35691 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnnO35691 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PnnO35691 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PnnO35691 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnnO35691 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PnnO35691 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PnnO35691 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PnnO35691 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PnnO35691 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnnO35691 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnnO35691 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnnO35691 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnnO35691 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnnO35691 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnnO35691 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnnO35691 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnnO35691 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnnO35691 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnnO35691 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnnO35691 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnnO35691 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PnnO35691 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PnnO35691 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PnnO35691 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PnnO35691 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PnnO35691 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PnnO35691 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PnnO35691 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnnO35691 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnnO35691 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnnO35691 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnnO35691 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnnO35691 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnnO35691 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PnnO35691 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnnO35691 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PnnO35691 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PnnO35691 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PnnO35691 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PnnO35691 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PnnO35691 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PnnO35691 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PnnO35691 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms