Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk4O35493 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk4O35493 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk4O35493 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk4O35493 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk4O35493 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clk4O35493 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk4O35493 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk4O35493 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clk4O35493 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk4O35493 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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