Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scarb2O35114 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scarb2O35114 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scarb2O35114 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarb2O35114 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarb2O35114 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarb2O35114 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarb2O35114 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarb2O35114 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scarb2O35114 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarb2O35114 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarb2O35114 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarb2O35114 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarb2O35114 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarb2O35114 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarb2O35114 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarb2O35114 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarb2O35114 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarb2O35114 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scarb2O35114 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarb2O35114 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarb2O35114 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarb2O35114 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarb2O35114 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarb2O35114 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarb2O35114 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarb2O35114 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarb2O35114 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scarb2O35114 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms