Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3cO35066 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3cO35066 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif3cO35066 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif3cO35066 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif3cO35066 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3cO35066 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kif3cO35066 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3cO35066 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms