Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ebf3O08791 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf3O08791 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ebf3O08791 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ebf3O08791 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms