Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Barx2O08686 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Barx2O08686 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Barx2O08686 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Barx2O08686 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Barx2O08686 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Barx2O08686 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Barx2O08686 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Barx2O08686 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Barx2O08686 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Barx2O08686 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Barx2O08686 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Barx2O08686 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms