Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc4lG5E8X2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc4lG5E8X2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4lG5E8X2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms