Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chrna9G3X8Z7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna9G3X8Z7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna9G3X8Z7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna9G3X8Z7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna9G3X8Z7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna9G3X8Z7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms