Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2210016F16RikG3X8U3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2210016F16RikG3X8U3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210016F16RikG3X8U3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2210016F16RikG3X8U3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2210016F16RikG3X8U3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms