Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r167G3UW71 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r167G3UW71 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r167G3UW71 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r167G3UW71 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms