Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XntrpcF8VQM8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XntrpcF8VQM8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XntrpcF8VQM8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XntrpcF8VQM8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.2 ms