Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
5830473C10RikF8VQ07 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5830473C10RikF8VQ07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
5830473C10RikF8VQ07 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830473C10RikF8VQ07 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms