Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zc3h7bF8VPP8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Zc3h7bF8VPP8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zc3h7bF8VPP8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zc3h7bF8VPP8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zc3h7bF8VPP8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zc3h7bF8VPP8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zc3h7bF8VPP8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zc3h7bF8VPP8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zc3h7bF8VPP8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zc3h7bF8VPP8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms