Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5218F6YH22 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5218F6YH22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms