Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5861F6VCN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5861F6VCN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5861F6VCN9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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