Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms