Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933403O08RikF6UK53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933403O08RikF6UK53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933403O08RikF6UK53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933403O08RikF6UK53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933403O08RikF6UK53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms