Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srsf11E9Q6E5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srsf11E9Q6E5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Srsf11E9Q6E5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srsf11E9Q6E5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms