Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930579F01RikE9Q3L6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930579F01RikE9Q3L6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms