Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm20425E9Q035 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20425E9Q035 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gm20425E9Q035 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms