Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E430018J23RikE9PZQ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms