Protein–RNA interactions for Protein: E9PZG0

Apol11a, Apolipoprotein L 11a, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol11aE9PZG0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol11aE9PZG0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Apol11aE9PZG0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol11aE9PZG0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol11aE9PZG0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms