Protein–RNA interactions for Protein: E9PZF0

Gm20390, Nucleoside diphosphate kinase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20390E9PZF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm20390E9PZF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20390E9PZF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20390E9PZF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm20390E9PZF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms