Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3002E9PW72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3002E9PW72 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3002E9PW72 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3002E9PW72 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3002E9PW72 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms