Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfp839E9PUU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp839E9PUU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp839E9PUU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp839E9PUU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms