Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
1110002E22RikE0CYV9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1110002E22RikE0CYV9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1110002E22RikE0CYV9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1110002E22RikE0CYV9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms