Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptrhd1D3Z4S3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptrhd1D3Z4S3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms