Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfbr3lD3YZZ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms