Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn24D3YXJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn24D3YXJ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn24D3YXJ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cldn24D3YXJ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn24D3YXJ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms