Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm4297D3YWB7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm4297D3YWB7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4297D3YWB7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4297D3YWB7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4297D3YWB7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms