Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Catsperg2C6KI89 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Catsperg2C6KI89 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Catsperg2C6KI89 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms