Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms