Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrn3B2RS91 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rrn3B2RS91 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrn3B2RS91 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrn3B2RS91 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms