Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arhgap42B2RQE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arhgap42B2RQE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap42B2RQE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap42B2RQE8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms