Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf3B2KF05 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf3B2KF05 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf3B2KF05 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Brpf3B2KF05 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms