Protein–RNA interactions for Protein: B1AXP3

Saxo1, MCG1697, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saxo1B1AXP3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Saxo1B1AXP3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Saxo1B1AXP3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Saxo1B1AXP3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Saxo1B1AXP3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Saxo1B1AXP3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms