Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms