Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a6B1AVK5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a6B1AVK5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a6B1AVK5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a6B1AVK5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms