Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PtpruB1AUH1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtpruB1AUH1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtpruB1AUH1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtpruB1AUH1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtpruB1AUH1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtpruB1AUH1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtpruB1AUH1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
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