Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Skint8A7XV07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skint8A7XV07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint8A7XV07 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint8A7XV07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint8A7XV07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint8A7XV07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms