Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prss40A6H6T1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prss40A6H6T1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prss40A6H6T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prss40A6H6T1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prss40A6H6T1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms