Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6880A3KG45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6880A3KG45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6880A3KG45 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6880A3KG45 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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