Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.8
Scn3aA2ASI5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scn3aA2ASI5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn3aA2ASI5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn3aA2ASI5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms