Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Shroom2A2ALU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Shroom2A2ALU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Shroom2A2ALU4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Shroom2A2ALU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Shroom2A2ALU4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Shroom2A2ALU4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Shroom2A2ALU4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Shroom2A2ALU4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Shroom2A2ALU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms