Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd7A2AJK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd7A2AJK6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd7A2AJK6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd7A2AJK6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 615.4 ms