Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdccag3A2AIW0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdccag3A2AIW0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdccag3A2AIW0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdccag3A2AIW0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms