Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3pxd2bA2AAY5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2bA2AAY5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms