Protein–RNA interactions for Protein: A2A9T0

Tbkbp1, TANK-binding kinase 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbkbp1A2A9T0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbkbp1A2A9T0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbkbp1A2A9T0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbkbp1A2A9T0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tbkbp1A2A9T0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbkbp1A2A9T0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms